A FAIND foi criada em 2012 (Portaria nº 435, de 21 de maio), como parte da Universidade Federal da Grande Dourados. Ela nasceu de uma longa luta e de sonhos compartilhados entre lideranças indígenas — especialmente Guarani e Kaiowá — professores, movimentos sociais e instituições de educação.
Essa faculdade oferece cursos com uma visão intercultural: respeitando, valorizando e construindo conhecimentos junto às comunidades indígenas e do campo. Busca formar professores e profissionais que caminhem junto com suas culturas, promovendo uma universidade aberta ao diálogo entre distintos saberes.
Desde antes da FAIND, em 2002, já existia o curso Ára Verá, para a formação de professores Guarani e Kaiowá. Esse curso foi um ponto de partida para construir uma educação que escute as vozes indígenas, que valorize suas línguas, histórias e modos de vida. Hoje, a FAIND amplia esse legado com cursos de Licenciatura Intercultural Indígena (Teko Arandu), Licenciatura em Educação do Campo (LEDUC), e programas de pós-graduação, extensão, pesquisa e cultura.